Sehubungan dengan visi sekolah agar siswa menjadi orang yang berakhlak dan bertaqwa kepada Tuhan Yang Maha Esa, maka perlu menambah jam kegiatan belajar yang menyangkut pendidikan agama.
Berdasarkan Perda no. 3 tahun 2009, tentang Pendidikan Al-Qur’an dijenjang sekolah menengah atas di Kalimantan Selatan, maka kegiatan belajar Baca Tulis Al-Qur’an (BTA) untuk siswa muslim di SMA PGRI 1 Banjarbaru, mulai semester ganjil akan dimulai tanggal 20 Agustus 2013 sampai menjelang ulangan semester, dan untuk semester genap jadwalnya akan ditentukan kemudian.
Penambahan jam belajar untuk BTA tersebut dilaksanakan 3 hari tiap minggu, yaitu tiap hari Senin, Selasa dan Rabu secara bergiliran antara kelas X, XI, dan XII, dari pukul 14.30 s.d. 16.00 WITA, dengan jadwal sbb :
1. Kelas X dan XI dilaksanakan setiap hari Senin dan Rabu
2. Kelas XII dilaksanakan setiap hari Selasa
Bagi siswa yang non muslim, sesuai dengan jadwal tersebut digunakan untuk belajar Bahasa Arab, karena Bahasa Arab adalah mata pelajaran pilihan sekolah untuk pelajaran Bahasa Asing.